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HomeRedesPlataforma de fenotipos y ensayos de campo

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Ensayos de campo y plataformas de fenotipado

El análisis genético (mapeo de QTL) y el análisis ecofisiológico se realizaron a partir de grandes bases de datos recogidas en ensayos de campo y de plataforma. Los experimentos de campo tenían como objetivo determinar la respuesta del rendimiento de los paneles SolACE a las variaciones en la disponibilidad de recursos. Las plataformas de fenotipado y los experimentos en condiciones controladas tenían como objetivo recoger datos sobre la arquitectura de las raíces y la respuesta del microbioma a las imitaciones de recursos combinados.

Se probó una amplia gama de genotipos de trigo en cuatro ensayos de campo en condiciones de control y de estrés combinado. Se probaron 250 genotipos de trigo pan en ensayos de campo en Levroux (Francia) y Gréoux-les-Bains (Francia). Otros 250 genotipos de trigo duro se analizaron en ensayos de campo en Foggia (Italia) y Mauguio (Francia). Además, los paneles de gran diversidad fueron fenotipados a nivel de la raíz en ensayos de la plataforma de fenotipado en Lovaina (Bélgica) y Dijon (Francia).

En una segunda fase, se seleccionaron 80 genotipos (40 de trigo pan y 40 de trigo duro) para analizarlos con mayor detalle en ensayos de campo semicontrolados en Gréoux-les-Bains y Clermont (Francia) y Copenhague (Dinamarca), así como en una plataforma de fenotipado en Montpellier (Francia).

Además de los ensayos con trigo duro y pan, también se probaron 24 variedades de patata en una plataforma de invernadero en Dundee, Escocia.

La información genética procedente de estos ensayos a gran escala y específicos se combinó en un marco de modelización que combina modelos estructurales funcionales de plantas (FSPM) y modelos de cultivos con el fin de mejorar nuestra comprensión del rendimiento de los cultivos bajo limitaciones.

Noticias sobre las pruebas de fenotipo

Understanding crop and microbiome responses to combined water and nutrient limitations

Part of the SolACE project analyses crop and microbiome responses to combined water and nutrient limitations. Genetic information from large-scale field and platform trials and physiological information from targeted trials are combined in a modelling framework, which couples Functional Structural Plant Models (FSPM) and crop models in order to improve our understanding of crop performance under limitations.

Map of ongoing SolACE field and platform experiments.

Diversity panels (approximately 250 genotypes) of bread and durum wheat and a collection of 24 potato varieties have been defined and assembled. The selection was made by the French National Institute of Agronomic Research (INRA), the National Research Council (CREA) in Italy, ARVALIS, the UK-Based James Hutton Institute and SOLYNTA and was based on a priori genetic and phenotypic information.

Two field trials were installed for each of the wheat panels during autumn 2017. Bread wheat trials were sown in Levroux (SYNGENTA, France) and Gréoux-les-Bains (ARVALIS, France), and durum wheat trials were sown in Foggia (CREA, Italy) and Mauguio (INRA, France). At all places, each genotype will be exposed to combined water and nitrogen limitations and compared to a control scenario. Field partners are currently working with modellers to establish the final list of variables that will be measured.

The 24 potato varieties have gone through a first greenhouse assay to confirm the interest of the collection. The next trials are in preparation. They will focus on root system architecture, yield and canopy development, and will come up with a novel diagnostic transcriptome test.

We will soon begin the high-throughput root phenotypic platform trials that will be performed at Université catholique de Louvain (Belgium) and at INRA-Dijon (France).
By the end of the summer, the field and platform data from wheat experiments will be analysed together and discussed broadly with partners to determine a short collection of 40 genotypes that will be analysed in more detail within intensified field and platform trials.

More information about work package 2.

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